SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
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Clontech 634485 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 24 Rxns ￥29,944 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634486 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥46,271 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634487 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥62,722 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634488 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 192 Rxns ￥112,114 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
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带分子标签的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本
· 操作简便：仅需要7.5小时即可完成文库构建
· 无缝衔接Illumina测序：直接制备多达192种index的Illumina® -ready文库
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian（Pico v3）设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒采用的技术适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且还添加特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向。
 
本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。整个流程，包括文库构建及纯化仅需约7.5小时。
该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Code No. 634451)。另外也可以与SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可单独购买）搭配使用，最多可构建多达192种indexes文库。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian技术流程
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备文库的结构特征
 
接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i7] 序列连接在P7端，Index 2 [i5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前8个碱基是UMI（深紫色），UMI之后的3个碱基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
表 1. 不同样本起始量的分析结果。
 
以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。
 
 
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