Wako 125-05061 赖氨酰肽链内切酶,MS级
Lysyl Endopeptidase®, Mass Spectrometry Grade (Lys-C)
赖氨酰肽链内切酶,MS级
品牌:Wako CAS No.: 储存条件:-20℃ 纯度:– 质谱级赖氨酰肽链内切酶 |
质谱级赖氨酰肽链内切酶
Lysyl Endopeptidase
本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸 基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。
来源:细菌
外观:冻干粉(包含2mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8)
活性:0.03~0.07AU/vial
分子量:27,000(琼脂糖过滤),30,000(SDS-PAGE)
溶解性:溶于水或缓冲液
稳定性:溶解于pH值5.0-12.0的Tris缓冲液中,可在4℃稳定保存2年;在pH值6.0-11.0 30℃时能稳定保存,但温度超过50℃时不稳定。
最适pH值:9.0~9.5
等电点:6.9~7.0
底物特异性:
可水解底物——Tos-Lys-OMe,Bz-Lys-NH2,Bz-Lys-pNA,Lys-pNA
不可水解底物——Bz-Arg-NH2,Bz-Arg-pNA,Arg-pNA
抑制剂:DFP,PMSF,TLCK
◆特点
● 高特异性、高蛋白质消化率、适用于蛋白质谱分析
● 提高裂解效率、增加肽段数量
● 根据使用量特意制备小包装,方便使用
◆应用
分别采用胰蛋白酶(Tp)、赖氨酰肽链内切酶(Lep) 和Tp与Lep联用进行胶内酶切的效果比较。
牛血清蛋白BSA 的条带(100ng) 通过SDS-PAGE 获得,然后分别用Tp、Lep和Lep+Tp进行酶切,再用MALDI-TOFMS法进行分析。
这些蛋白酶的实验效果见下表。
表 1:Tp、Lep和Lep+Tp的结果对照
这些结果表明Lep酶解的错误裂解率低。Tp酶解时加入Lep后,错误裂解率有所降低,同时,可以鉴定出更多的多肽。
Tp | Lep | Lep +Tp | |
裂解位点 | 精氨酸和赖氨酸的C端 | 赖氨酸的C端 | 精氨酸和赖氨酸的C端 |
错误裂解率( 错误裂解所占比例 ) | 多(8%) | 很少(0%) | 少(3%) |
鉴定出的多肽数量 | 17 | 19 | 22 |
胰蛋白酶 (Tp)( 图 a) 和赖氨酰肽链内切酶 (Lep)+Tp ( 图 b) 酶切后的质谱结果对照图。
Lep+Tp酶切后,可以在m/z=2000时得到吸收峰,而单独的Tp酶切在m/z=2000时没有吸收峰。该结果表明Lep可以提高测序覆盖度。
( 数据由大阪医疗中心和妇婴健康研究所Y. Wada博士提供 )
赖氨酰肽链内切酶
赖氨酰肽链内切酶,最初由Masaki 等人从土壤细菌中分离得到。该酶可以特异性剪切赖氨酸残基C 末端和S-氨乙基半胱氨酸残基的肽键,用于蛋白测序和Lys-X 化合物的酶催化合成。该酶稳定性高,在4M 尿素或0.1%SDS 溶液中30℃孵育6小时之后,仍然拥有完整的生物活性。
外观 | 冻干粉(包含ca. 10% Tris-HCl buffer,pH 8) | 活性 | 见包装 |
分子量 | 27,000(凝胶过滤);30,000 (SDS-PAGE) | 溶解性 | 易溶于水或缓冲液 |
最佳pH | 9.0-9.5(酰胺酶的最佳活性pH) | 等电点 | 6.9-7.0 |
抑制剂 | DFP、PMSF、TLCK | 来源 | 细菌 |
稳定性 | 溶于pH 值5.0-12.0 的缓冲液中,可于4℃稳定保存。溶于pH值6.0-11.0的缓冲液中,可于30℃稳定保存,但是50℃及以上不稳定。 | ||
单位定义 | 一单位酰胺酶(AU) 指在30℃ pH9.5 时每分钟产生1μmol对硝基苯胺所需的酶量。 | ||
底物特异性 | 水解底物:Tos-Lys-Ome、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA | ||
非水解底物:Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNa、Arg-pNA |
实验方法:
1. 试剂:
A.0.2 mol/L AMP 缓冲液,pH值9.5
溶解4.2g的2-氨基-2-甲基-1,3-丙二醇于150 mL的水中,加入1 mol/L HCl调pH值至9.5,再加水使体积至200 mL。
B.2.5 mmol/L 底物溶液
溶解22.6 mg的N-苯甲酰基-DL-精氨酰-4-硝基苯胺盐酸盐于20 mL水中。
C. 2 mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8
溶解0.24 mg的2-氨基-2-羟甲基-1,3-丙二醇于900mL水中,加入0.1 mol/L HCl调pH值至8,再加水使体积至1L。
D. 酶溶液
溶解1vial的赖氨酰肽链内切酶于1 mL的溶剂C中,可直接加入。
E.终止溶液
将55 mL水和45 mL乙酸混合均匀。
2. 步骤
试剂 | 检测样品 | 空白对照 |
A | 2.6 mL | 2.6 mL |
B | 0.3 mL | 0.3 mL |
30℃预培养5分钟 | ||
D | 0.1 mL | – |
C | – | 0.1 mL |
立即混合均匀,30℃预培养25分钟 | ||
E | 1.0 mL | 1.0 mL |
3. 单位的定义
酰胺酶单位是指30℃ pH9.5时,每分钟产生1 umol对硝基苯胺的酶量。
AU/vial = [(a-b) / 25] × (1 / 9.62) × (4.0 / 0.1)
a. 检测样品中的吸光度
b. 空白对照中的吸光度
胶内酶切的实验操作流程
用聚硅酮处理的微量离心管和吸管端防止捕获任何蛋白。使用质谱分析用凝胶染色试剂盒,例如银染剂MS试剂盒(产品编号:299-58901)和负凝胶染色MS试剂盒(产品编号:293-57701)
1. 电泳分离蛋白质样品;
2. 从凝胶中切割蛋白质片断并放入微量离心管;
3. 使凝胶脱色(可使用质谱分析用凝胶染色试剂盒中的脱色溶液);
4. 加入300 uL乙腈到试管里,搅拌器振荡30分钟;
5. 去除乙腈,用Parafilm膜覆盖微量离心管。
6. 在Parafilm膜上打出针孔,真空干燥15分钟;
7. 100 uL 10 mmol/L DTT溶解于100 mmol/L 碳酸氢铵,56℃恒温1小时。
8. 室温冷却后,用等量的50mM碘乙酰胺溶解于100 mmol/L 碳酸氢铵,暗处恒温45分钟并涡旋;
9. 用100 uL 100 mmol/L碳酸氢铵洗涤凝胶片段10分钟;
10. 用300 uL乙腈干燥凝胶片段15分钟;
11. 用100 uL 100 mmol/L碳酸氢铵溶胀凝胶片段15分钟;
12. 用300 uL乙腈再次干燥凝胶片段15分钟;
13. 去除液相,真空干燥凝胶片段15分钟;
14. 用100 uL赖氨酸内切酶溶液*在冰水浴中溶胀凝胶片段45分钟;
*赖氨酸内切酶稀释于50 mmol/L Tris-HCl pH 8.5;
15. 去除100 uL赖氨酸内切酶溶液,将凝胶片段放在37℃ 10 uL 50 mmol/L Tris-HCl pH 8.5中过夜;
16. 加入50 uL 20mmol/L碳酸氢铵20分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;
17. 加入5%甲酸/50%乙腈20分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;
18. 如果需要用Speed Vac.浓缩多肽;
19. 用ZipTip脱盐和纯化多肽;
20. 如果需要用弱真空浓缩多肽至2 uL;
21. 加入基质进行质谱分析。
注意:根据细菌的生理和形态特征分类,产品来源为水解无色杆菌,但是最近细菌分类学将这种细菌鉴定为产酶溶杆菌。
保存:暗处-20℃保存
规格:20 ug×5vial
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赖氨酰肽链内切酶,MS级
产品编号:125-05061