Wako 125-05061 赖氨酰肽链内切酶说明书


Wako 125-05061 赖氨酰肽链内切酶,MS级

Lysyl Endopeptidase®, Mass Spectrometry Grade (Lys-C) 

赖氨酰肽链内切酶,MS级

品牌:Wako
CAS No.:
储存条件:-20℃

纯度:–

质谱级赖氨酰肽链内切酶
Lysyl Endopeptidase


质谱级赖氨酰肽链内切酶

Lysyl Endopeptidase

本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸 基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。

来源:细菌

外观:冻干粉(包含2mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8)

活性:0.03~0.07AU/vial

分子量:27,000(琼脂糖过滤),30,000(SDS-PAGE)

溶解性:溶于水或缓冲液

稳定性:溶解于pH值5.0-12.0的Tris缓冲液中,可在4℃稳定保存2年;在pH值6.0-11.0 30℃时能稳定保存,但温度超过50℃时不稳定。

最适pH值:9.0~9.5

等电点:6.9~7.0 

底物特异性:

可水解底物——Tos-Lys-OMe,Bz-Lys-NH2,Bz-Lys-pNA,Lys-pNA

不可水解底物——Bz-Arg-NH2,Bz-Arg-pNA,Arg-pNA

抑制剂:DFP,PMSF,TLCK

特点

●  高特异性、高蛋白质消化率、适用于蛋白质谱分析

●  提高裂解效率、增加肽段数量

●  根据使用量特意制备小包装,方便使用

应用

分别采用胰蛋白酶(Tp)、赖氨酰肽链内切酶(Lep) 和Tp与Lep联用进行胶内酶切的效果比较。

牛血清蛋白BSA 的条带(100ng) 通过SDS-PAGE 获得,然后分别用Tp、Lep和Lep+Tp进行酶切,再用MALDI-TOFMS法进行分析。

这些蛋白酶的实验效果见下表。

表 1:Tp、Lep和Lep+Tp的结果对照

这些结果表明Lep酶解的错误裂解率低。Tp酶解时加入Lep后,错误裂解率有所降低,同时,可以鉴定出更多的多肽。

Tp  Lep  Lep +Tp
裂解位点 精氨酸和赖氨酸的C端  赖氨酸的C端  精氨酸和赖氨酸的C端
错误裂解率(  错误裂解所占比例  ) 多(8%) 很少(0%) 少(3%) 
鉴定出的多肽数量  17 19 22

胰蛋白酶 (Tp)( 图 a) 和赖氨酰肽链内切酶 (Lep)+Tp ( 图 b) 酶切后的质谱结果对照图。

Lep+Tp酶切后,可以在m/z=2000时得到吸收峰,而单独的Tp酶切在m/z=2000时没有吸收峰。该结果表明Lep可以提高测序覆盖度。

( 数据由大阪医疗中心和妇婴健康研究所Y. Wada博士提供 )

赖氨酰肽链内切酶

赖氨酰肽链内切酶,最初由Masaki 等人从土壤细菌中分离得到。该酶可以特异性剪切赖氨酸残基C 末端和S-氨乙基半胱氨酸残基的肽键,用于蛋白测序和Lys-X 化合物的酶催化合成。该酶稳定性高,在4M 尿素或0.1%SDS 溶液中30℃孵育6小时之后,仍然拥有完整的生物活性。

外观 冻干粉(包含ca. 10% Tris-HCl buffer,pH 8) 活性 见包装
分子量 27,000(凝胶过滤);30,000 (SDS-PAGE) 溶解性 易溶于水或缓冲液
最佳pH 9.0-9.5(酰胺酶的最佳活性pH) 等电点 6.9-7.0
抑制剂 DFP、PMSF、TLCK 来源 细菌
稳定性  溶于pH 值5.0-12.0 的缓冲液中,可于4℃稳定保存。溶于pH值6.0-11.0的缓冲液中,可于30℃稳定保存,但是50℃及以上不稳定。
单位定义  一单位酰胺酶(AU) 指在30℃ pH9.5 时每分钟产生1μmol对硝基苯胺所需的酶量。
底物特异性  水解底物:Tos-Lys-Ome、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA
 非水解底物:Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNa、Arg-pNA

实验方法:

1. 试剂:

A.0.2 mol/L AMP 缓冲液,pH值9.5

溶解4.2g的2-氨基-2-甲基-1,3-丙二醇于150 mL的水中,加入1 mol/L HCl调pH值至9.5,再加水使体积至200 mL。

B.2.5 mmol/L 底物溶液

溶解22.6 mg的N-苯甲酰基-DL-精氨酰-4-硝基苯胺盐酸盐于20 mL水中。

C.  2 mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8

溶解0.24 mg的2-氨基-2-羟甲基-1,3-丙二醇于900mL水中,加入0.1 mol/L HCl调pH值至8,再加水使体积至1L。

D. 酶溶液

溶解1vial的赖氨酰肽链内切酶于1 mL的溶剂C中,可直接加入。

E.终止溶液

将55 mL水和45 mL乙酸混合均匀。

2. 步骤

试剂 检测样品 空白对照
A 2.6 mL 2.6 mL
B 0.3 mL 0.3 mL
30℃预培养5分钟
D 0.1 mL
C 0.1 mL
立即混合均匀,30℃预培养25分钟
E 1.0 mL 1.0 mL

3. 单位的定义

酰胺酶单位是指30℃ pH9.5时,每分钟产生1 umol对硝基苯胺的酶量。

AU/vial = [(a-b) / 25] × (1 / 9.62) × (4.0 / 0.1)

a.    检测样品中的吸光度

b.    空白对照中的吸光度

胶内酶切的实验操作流程

用聚硅酮处理的微量离心管和吸管端防止捕获任何蛋白。使用质谱分析用凝胶染色试剂盒,例如银染剂MS试剂盒(产品编号:299-58901)和负凝胶染色MS试剂盒(产品编号:293-57701)

1.    电泳分离蛋白质样品;

2.    从凝胶中切割蛋白质片断并放入微量离心管;

3.    使凝胶脱色(可使用质谱分析用凝胶染色试剂盒中的脱色溶液);

4.    加入300 uL乙腈到试管里,搅拌器振荡30分钟;

5.    去除乙腈,用Parafilm膜覆盖微量离心管。

6.    在Parafilm膜上打出针孔,真空干燥15分钟;

7.    100 uL 10 mmol/L DTT溶解于100 mmol/L 碳酸氢铵,56℃恒温1小时。

8.    室温冷却后,用等量的50mM碘乙酰胺溶解于100 mmol/L 碳酸氢铵,暗处恒温45分钟并涡旋;

9.    用100 uL 100 mmol/L碳酸氢铵洗涤凝胶片段10分钟;

10.  用300 uL乙腈干燥凝胶片段15分钟;

11.  用100 uL 100 mmol/L碳酸氢铵溶胀凝胶片段15分钟;

12.  用300 uL乙腈再次干燥凝胶片段15分钟;

13.  去除液相,真空干燥凝胶片段15分钟;

14.  用100 uL赖氨酸内切酶溶液*在冰水浴中溶胀凝胶片段45分钟;

*赖氨酸内切酶稀释于50 mmol/L Tris-HCl  pH 8.5;

15.  去除100 uL赖氨酸内切酶溶液,将凝胶片段放在37℃ 10 uL 50 mmol/L Tris-HCl pH 8.5中过夜;

16.  加入50 uL 20mmol/L碳酸氢铵20分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;

17.  加入5%甲酸/50%乙腈20分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;

18.  如果需要用Speed Vac.浓缩多肽;

19.  用ZipTip脱盐和纯化多肽;

20.  如果需要用弱真空浓缩多肽至2 uL;

21.  加入基质进行质谱分析。

注意:根据细菌的生理和形态特征分类,产品来源为水解无色杆菌,但是最近细菌分类学将这种细菌鉴定为产酶溶杆菌。

保存:暗处-20℃保存

规格:20 ug×5vial

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赖氨酰肽链内切酶,MS级

产品编号:125-05061