dovetailgenomics 21006说明书

Dovetail™ Micro-C Kit在邻近连接之前使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 进行染色质消化。该试剂盒提供了在生成 NGS 文库之前对哺乳动物样本进行邻近连接步骤所需的所有试剂。该试剂盒与用于 Illumina 的 Dovetail™ 文库模块（货号 #25004）和用于 Illumina 测序的第 3 方标准双端文库制备试剂盒兼容。

Dovetail Micro-C 套件具有以下主要优点：

• 与序列无关的染色质片段化甚至可以在全基因组范围内检测染色质接触（使用基于限制性酶的 Hi-C 方法无法覆盖多达 20% 的基因组）

• 染色质接触的超高核小体水平分辨率

• 最高的信噪比数据，同时丰富了远程信息读取和核小体保护片段

Dovetail Micro-C 库丰富了所需的 Hi-C 特性

所述MNase酶既具有不依赖序列的内切核酸酶和外切核酸酶活所以产生的片段是核小体的长度（146碱基对）。该协议的邻近结扎部分经过优化，以最大限度地提高远程交互。由此产生的高度均匀的短片段能够实现染色质接触的核小体水平分辨率，这是理论分辨率的最大值。

改进的拓扑特征调用

在邻近连接数据中检测更高阶特征（例如染色质环）的能力取决于丰富远程信息读取以捕获染色质相互作用频率。与基于 RE 的方法相比，增加的染色体构象信息读取结合超高分辨率改善了循环调用。

Dovetail Micro-C *地捕捉核小体定位

用MNase消化的染色质显示了在 Dovetail™ Micro-C 文库中可见的全基因组核小体图谱。该图由与受核小体保护的 DNA 相关的序列读取峰和代表可被MNase消化的干预 DNA 的谷组成。这种振荡发生在 ~146 bp 的频率（包裹在单核小体周围的 DNA 长度）。此功能是 Micro-C 数据的，因为它在基于 RE 的方法中不存在。Dovetail™ Micro-C 实现的全基因组核小体定位和超分辨率染色体拓扑结构相结合，有助于从核小体到核小体染色质接触的映射。