DNASU质粒库可以减轻个体实验室存储和维护质粒数据和样品的负担,并将这些质粒分发给世界各地的研究人员。DNASU目前拥有越来越多的200,000多种质粒,其中包含来自600多种生物的基因,其中包括在LaBaer实验室中创建的克隆以及来自外部研究人员的各种克隆。我们还有两个重要的合作。作为ORFeome Collaboration的创始成员,我们参与创建了数千种人类和小鼠基因,并且是ORFeome Collaboration质粒和质粒集合的关键分析者。自2006年起,作为PSI:Biology-Materials Repository,我们对NIGMS资助的蛋白质结构倡议(PSI)研究人员创建的数万个表达就绪克隆进行了序列验证和分发。
进入我们实验室的每个样品都经过序列验证,每个质粒的注释都存储在基于Oracle的数据库中。样品存储在先进的Brooks BioStore冷冻储存和回收系统(由NIGMS ARRA资助资助)中,使我们能够分离质粒并快速检索所需的质粒。通过本网站可以搜索质粒信息,点击克隆ID或载体名称即可找到有关每种质粒的更多信息。我们通过我们的网站向超过550个实验室分发了200,000多种质粒,从而使研究人员能够对生物学和疾病中基因和蛋白质的功能作用进行尽可能广泛的实验。
除了分发材料外,MR还寻求简化MTA流程,以减少机构存放或接收质粒所需的时间。为了实现这一目标,MR开创了两个文件,即存款人的协议,其中规定了使MR能够从外部机构分发存放的质粒的条款,以及加速的过程MTA,这使得研究人员无需等待其机构签署MTA。未来,MR将继续为研究人员提供PSI质粒和数据,并将扩展其加速的MTA网络,以便研究人员能够毫不拖延地接收PSI质粒。
PSI:生物学 – 材料库(PSI:Biology-MR)
该蛋白质结构计划的(PSI)的主要科学任务是使大多数蛋白质的三维原子水平结构,很容易从它们对应的DNA序列的知识获得。迄今为止,已有超过5,100种蛋白质结构被28个当前和3个前大型结构基因组学中心确定为NIGMS资助的PSI项目的一部分。2010年夏季开始的PSI下一阶段PSI:生物学的目标是继续解决蛋白质结构并将高通量结构生物学应用于重要的生物学问题,其中包括鼓励结构生物学家和研究人员之间建立伙伴关系。生物,生物化学和/或分子社区
为了表达,纯化,结晶和解决这些蛋白质家族和生物靶标的结构,已经产生了超过100,000个含有从宿主生物体获得的基因组DNA克隆的基因的质粒克隆。这些克隆中的许多对研究人员特别有价值,因为我们已经测试并记录了它们产生蛋白质的能力,包括蛋白质是否可溶并且可以被纯化。所有这些信息都可以通过DNASU捕获和搜索。通过单击CloneID并链接到PSI Structural Biology Knowledgebase和Protein Data Bank,也可以找到有关每个克隆的其他生物学和结构信息。
该蛋白质结构计划,材料仓库(PSI-MR),现在PSI:生物基材料库,于2006年与存储,维护和发布所有PSI的研究人员创造了超过10万个克隆的任务创建。此外,每个克隆在进行分发之前都经过序列验证,确保发送给研究人员的克隆是正确的。截至2014年2月,超过82,000个PSI质粒可供分发。
DNASU产品介绍
物/收藏品名称 | 向量 | 集合中的克隆数量 | 学术/非营利机构 | 所有其他 研究员 |
---|---|---|---|---|
90/90人类ORFeome V1 – 完整系列 | 90/90人类ORFeome V 1(网关入口矢量) – 完整集合 | 1,1368 | $ 28420 | $ 39788 |
90/90人类ORFeome V 1(网关表达载体:pANT7 cGST) – 完整集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
90/90人类ORFeome V1 – 膜蛋白 | 90/90人类ORFeome V 1(网关进入载体) – 膜蛋白质子收集 | 4187 | $ 10467.50 | $ 14654.50 |
90/90人ORFeome V 1(Gateway表达载体:pANT7 cGST) – 膜蛋白Sub集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
90/90人类ORFeome V1 – 转录因子 | 90/90人类ORFeome V 1(网关条目向量) – 转录因子子集 | 1500 | $ 3750 | $ 5250 |
90/90人ORFeome V 1(Gateway表达载体:pANT7 cGST) – 转录因子Sub集合 | 1342 | $ 3355 | $ 4697 | |
90/90人类ORFeome V1 – 其他ORFs | 90/90人类ORFeome V 1(网关条目向量) – 其他ORFs子集 | 5,682 | $ 14205 | $ 19887 |
90/90人类ORFeome V 1(网关表达载体:pANT7 cGST) – 其他子集合 | 5605 | $ 14012.50 | $ 19617.50 | |
1000个与人乳腺癌相关的基因组 | pDNR-Dual,C端子标签 | 1155 | $ 2887.50 | $ 4042.50 |
pDNR-Dual,全套 | 2,201 | $ 5502.50 | $ 7703.5 | |
pDNR-Dual,无标记 | 1046 | $ 2615 | $ 3661 | |
人类激酶集合 | pDNR双,全套 | 632 | $ 1580年 | $器2212 |
pDNR双C端子标签 | 543 | $ 1357.5 | $ 1900.50 | |
pJP1520逆转录病毒载体 | 651 | $ 1627.50 | $ 2278.50 | |
pJP1563逆转录病毒载体 | 636 | $ 1590年 | $ 2226 | |
人类转录因子的收集 | pLenti6.2 / V5-DEST慢病毒载体 | 981 | $ 2452.50 | $ 3433.50 |
人类ORFeome V8.1 | pENTR223网关入门载体质粒集合 | 12791 | $ 31977.50 | $ 44768.50 |
pLX304 lentivrial表达集合 | 13,242 | $ 33105 | $ 46347 | |
人类表达克隆集合 | pANT_cGST无细胞表达与C末端GST标签 | 12326 | $ 30815 | $ 43141 |
具有Flag标签的pLDNT7_nFLAG无细胞表达载体 | 2123 | $ 5307.50 | $ 7430.50 | |
使用GST和Flag标记的载体完成收集 | 2688 | $ 6720 | $ 9408 | |
炭疽杆菌 | pANT_cGST无细胞表达与C末端GST标签 | 4,708 | $ 11770 | $ 16478 |
pDONR221载体 | 5341 | $ 13352.5 | $ 18693.50 | |
Francisella tularensis | pDEST17大肠杆菌表达载体 | 1464 | $器3660 | $ 5124这两款 |
pDONR221载体 | 1507 | $ 3767.50 | $ 5274.50 | |
pBY011_GFP-NH3_CN带标签的酵母表达载体 | 1333 | $ 3332.50 | $ 4665.50 | |
铜绿假单胞菌 | pDONR201载体 | 2383 | $ 5957.50 | $ 8340.50 |
酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | ZM552表达载体 | 5092 | $ 12730 | $ 17822 |
pBY011表达载体 | 5529 | $ 13837.50 | $ 19372.50 | |
pDONR201或221载体 | 5,333 | $ 13332.50 | $ 18665.50 | |
霍乱弧菌 | pANT_cGST无细胞表达与C末端GST标签 | 3,310 | $ 8275 | $ 11585 |
pDONR221载体 | 3,777 | $ 9442.50 | $ 13219.50 | |
鼠疫耶尔森氏菌 | pDONR221载体 | 3,968 | $ 9920 | $ 13888 |
耶尔森氏菌假结核 | pDONR221载体 | 271 | $ 677.50 | $ 948.50 |