高灵敏度的单细胞全长mRNA分析 | ||||||
品牌 | Code No. | 产品名称 | 包装量 | 价格(元) | 说明书 | 数量 |
Clontech | 634470 | SMART-Seq Single Cell Kit | 12 Rxns | ¥13,341 | ||
Clontech | 634471 | SMART-Seq Single Cell Kit | 48 Rxns | ¥37,759 | ||
Clontech | 634472 | SMART-Seq Single Cell Kit | 96 Rxns | ¥65,697 |
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高灵敏度的单细胞全长mRNA分析 SMART-Seq Single Cell Kit |
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· 简便的工作流程-可以FACS或其他方法分选的单细胞起始 · 灵敏度高、一致性好-非常适用于单细胞(尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核)RNA-Seq的研究,可检测更多基因 · 可靠的全长cDNA制备Kit-优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2 · 高度灵活的工作流程-可与自动化设备兼容 |
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SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)是一个具有高灵敏度和可再现的cDNA制备试剂盒,适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。该试剂盒可以从已知具有低RNA含量的单个细胞(例如,PBMC)直接生成高质量的全长cDNA。该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良,具有更高的灵敏度和再现性。远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2和Takara Bio现有试剂盒(SMART-Seq V4)。 |
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图1. 与Smart-seq2法的比较 |
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以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析(所有样本都均一化至1.75M paired-end reads)。 |
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Panel A cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。 | |
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。 | |
图2. 与SMART-Seq v4的比较 |
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Panel A 以淋巴母细胞系GM22601单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)和SMART-Seq v4(SSv4)合成cDNA(均用19个PCR循环扩增)。所有样本都均一化至1.25M paired-end reads。使用SSsc建库,能获得更高的文库产量。 | |
Panel B 从一位健康供体收集到约50个PMBC单细胞,分别采用SSv4 和 SSsc制备cDNA,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。不论测序深度如何,SMART-Seq Single Cell Kit检测的基因数均是SMART-Seq v4的1.6倍以上。 | |
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