靶向RNA-Seq,捕获全长转录本信息—SMARTer Target RNA Capture for Illumina |
· 低至10 ng纯化总RNA起始 · 特定富集目标转录本的简便流程 · 以富集的DNA构建Illumina-ready全长文库 · 文库制备中不需要接头连接即可添加测序接头库 |
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SMARTer Target RNA Capture for Illumina 是设计用于从富集的总RNA中构建cDNA文库的完整系统。靶向RNA-seq可以克服全转录组扩增(WTA)RNA-seq的多种挑战,提高测序覆盖度及低丰度目标转录本的检测灵敏度。靶向RNA-seq同时也具有节省成本及简化分析的优势。在cDNA合成前富集目标转录本可以捕获那些易丢失转录本或需要很多测序数据才能被检测到的转录本的信息,包括嵌合基因融合,转录异构体,剪接变异体。 SMARTer Target RNA Capture for Illumina的操作流程中,总RNA与使用者设计的生物素标记的DNA探针杂交不到4 h,纯化后采用Capture Beads(链霉亲和素包被的磁珠)捕获。Capture Beads是经过挑选的,具有格外低的蛋白和核酸吸附性,并且不会干扰下游反应,如PCR或反转录,使得靶标样品可以附着在磁珠上直接进行cDNA合成。 基于SMART-Seq v4 Ultra Low Input Kit的灵敏度,本试剂可以富集的转录本获得高质量的全长cDNA。试剂设计用于低至10 ng总RNA起始,我们甚至可以从低至100 pg的总RNA起始获得成功实验,详情请参考Technote。本试剂使用oligo (dT) 引物起始,设计用于高品质样品,不需要额外的rRNA去除试剂或方法,构建适用于Illumina测序平台的测序文库。 |
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图1. SMARTer Target RNA Capture for Illumina操作流程 |
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Technote: 点击图片查看 |
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