· 一次性预分装联排管,不同试剂间使用颜色标记区分 · 在有效范围内,无论起始量高低,均能生成重复性好、质量高的NGS文库 · 良好应对各种实验样本通量 |
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■ 应用领域 |
· 一致的DNA-seq、RNA-seq、ChIP-seq文库制备无缝式解决方案 · Illumina测序平台测序文库自动化制备,无需大量繁琐的手动操作 |
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■ 产品说明 |
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SMARTer PrepX系列试剂盒提供了Illumina测序文库制备必需的每一种试剂。相关试剂已预分装在单次使用的联排管中,并使用不同的颜色区分标记,可以轻松完成SMARTer Apollo系统操作台面布置工作。SMARTer PrepX系列试剂盒和相关程序脚本的设计融入了灵活性,以适应不同样本通量的需求。设置过程十分简单:只需按照图形用户界面的相关提示将试剂放到指定位置,布置好操作台面,点击“Run”即可,无需人员看管。 |
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■ 性能表现 |
样本起始量和样本质量对于任何测序应用来说都需要着重注意。在实验流程中使用过多的样品或得到的产量很低意味着浪费材料、拖延实验进度、糟糕的实验结果、下游测序实验难以开展。SMARTer PrepX试剂盒配合相关程序脚本通过生成一致的、高质量的NGS文库解决这些困扰。在有效的范围内,不再担心样本起始浓度的影响(Table I)。 |
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Table I. 可靠的测序覆盖度和表现 |
Input amount |
10 ng |
100 ng |
Adapter reads (%) |
0 |
0 |
Confidently mapped read (%) |
96.61 |
96.43 |
Repetitive reads (%) |
1.84 |
1.80 |
Low-quality reads (%) |
0 |
0 |
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上述实验,使用SMARTer Apollo系统,搭配SMARTer PrepX DNA Library Kit,从10 ng和100 ng E. coli基因组DNA中完成高质量文库制备。获得的文库使用Illumina MiSeq?平台进行测序(2 × 150 bp)。 |
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■ 上样量要求 |
每一种SMARTer PrepX试剂与一个对应不同通量的脚本相兼容,有最小样本上样量的需求。相关总结见Table II。 |
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Table II. SMARTer PrepX kits与SMARTer Apollo预编程脚本不同组合所需样本量 |
Code No. |
SMARTer Apollo试剂盒 |
兼容脚本 |
脚本通量 |
最小上样量/样本 |
640101* |
SMARTer PrepX DNA Library Kit |
PrepX ILMN 8 |
1-8 |
1 ng DNA |
640102* |
SMARTer PrepX DNA Library Kit |
PrepX ILMN 32i |
4-32 |
1 ng DNA |
640096 |
PrepX RNA-Seq for Illumina LibraryKit,24 Samples |
PrepX small RNA 8 |
1-8 |
100 pg poly A-enriched RNA or 2 ng rRNA-depleted mRNA(PrepX mRNA 8) |
100 pg total RNA (PrepX small RNA 8) |
640097 |
PrepX RNA-Seq for Illumina Library Kit, 48 Samples |
PrepX mRNA 48 |
6-48 |
100 pg poly A-enriched RNA or 2 ng rRNA-depleted mRNA(PrepX mRNA 48) |
PrepX small RNA 48 |
100 pg total RNA (PrepX small RNA 8) |
640098 |
SMARTer PrepX PolyA mRNA Isolation Kit, 96 Samples |
PrepX PolyA 8 or PrepX PolyA 48 |
1-8 or 6-48 |
100 ng total RNA |
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* Code No.640101提供足够运行24个样本的试剂量,每批次多达8个样本。Code No. 640102提供足够运行96个样本的试剂量,每批次多达32个样本。 |
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