自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)酶试剂盒Takara

自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	640257	SMART-Seq Pro Application Kit	2 Chips	询价
Clontech	640192	ICELL8^® 384-Well Source Plate and Seal	Each	询价
Clontech	640018	MSND 384-Well Source Plate and Seal	20/Pack	询价

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SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案

全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析，并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System（Cat No. 640188）相结合，并整合了生物信息学工具，提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程，一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip（Cat No. 640019）空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔，文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后，获得无偏倚的全长cDNA，并通过Illumina Bead-Linked Transposome（BLT）完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中，cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列，生成的文库已连接index接头，可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后，获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析，解释测序结果。

NOTE：旧版本SMART-Seq Application Kit（Cat No. 640222）依然可以购买。

更多孔板测序应用，请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq

■ 概述

· 端到端的解决方案：从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA：捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物，如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析：可以平行地从＞1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活：一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作：减小数据波动，构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞，仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库：制备的测序文库适用于Illumina全系平台

■应用

用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备

图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较

Technote：
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