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firebirdbio SNAP2产品

发表于由

Firebirdbio提供解决实验室和诊所问题的试剂创新

  • 具有额外遗传字母的DNA，人工扩展的遗传信息系统（AEGIS）
    • 亚磷酰胺可化学合成带有多余字母的DNA
    • 三磷酸酯酶法合成带有多余字母的DNA
    • 三磷酸酯酶合成带有额外字母的RNA
    • 设计AEGIS寡核苷酸的工具
    • 可以复制AEGIS DNA的酶来制造更多AEGIS DNA
    • 由AEGIS DNA制成AEGIS RNA的酶
    • 使用嵌套PCR架构的超净PCR试剂盒
    • 3'-氨基氧基保护的AEGIS三磷酸酯
  • 用于多路复用和设计的自我避免分子识别系统（SAMRS）
    • 亚磷酰胺化学合成SAMRS DNA
    • 三磷酸酶合成SAMRS DNA
    • 三磷酸酯酶法合成SAMRS RNA
    • 设计SAMRS寡核苷酸的工具
  • 带有3'-氨基可移动保护基团的三磷酸酯
    • 3'-氨基氧基三磷酸用于酶促DNA合成和DNA测序
    • 标记的3'-氨基三磷酸用于酶促DNA标记和测序
  • 双向核苷可控制PCR靶标中的序列差异

firebirdbio SNAP2产品

具有高特异性和高区分性的引物

 

特定的DNA启动需要寡核苷酸具有≥16个核苷酸的互补性，但具有区分单个错配的能力。模板上引物的动态组装可以提供此功能。

 

 

 

含醛前体的可控孔玻璃

SNAP2T_HJK001 100毫克 $ 600.00

 

Firebird出售带有SNAP2末端的亚磷酰胺，寡聚体和文库。

 

 

 

 

firebirdbio Biversal产品

发表于由

 

BiversalTM Nucleotides

 

firebirdbio Biversal产品

病原体基因组中存在的差异使得很难或不可能设计出一个单一的探针或引物，该探针或引物是所有可能靶序列的精确互补。实际上，这是使用简并或“通用碱基”（例如肌苷）来处理的。

火鸟科学家创造了两个“生物” TM。每种均以两种互变异构形式存在，可提供交替的氢键键合模式。这使得嘧啶遍在与鸟嘌呤或腺嘌呤配对，而嘌呤遍在与胸腺嘧啶或胞嘧啶配对。这些碱基为PCR扩增和SNP检测中处理不同序列的现有方法提供了新的选择。

 

嘧啶遍历的互变异构形式：

 

 

嘌呤遍历的互变异构形式：

 

遍历亚磷酰胺

 

嘧啶双向亚磷酰胺
线性公式C 41 H 50 N 5 O 8 P 
摩尔重量771.84

 

货号 Pyr-BiVer

 

100毫克 $ 500.00
1克 $ 4000.00

 

嘌呤双向亚磷酰胺
线性公式C 50 H 62 N 7 O 9 P 
摩尔重量936.04

 

货号：Pur-BiVer

 

100毫克 $ 2850.00
1克 查询

 

 

Firebird销售含有嘌呤和嘧啶二元化合物的寡核苷酸。

 

firebirdbio自回避分子识别系统

发表于由

firebirdbio自回避分子识别系统（SAMRS 

核酸扩增反应遭受脱靶扩增产物的形成。该问题随着反应中引物的数量而增加，并且主要由于引物-引物相互作用而发生。因此，从引物碱基中选择性除去氢键合单元会导致产生自我逃避的DNA引物，可以添加这些引物以实现和改善多重PCR。

 

如下所示，带*的SAMRS碱基可以与标准碱基（在靶标或扩增子中）成对，但不能与其他SAMRS碱基成对。

            
                                    

 自回避分子识别系统-SAMRS TM
亚磷酰胺和寡核苷酸

 

 

T* phosphoramidite
1g $1050
10g $8220
A* phosphoramidite
1g $655
10g $5340
C* phosphoramidite
1g $394
10g $3150
G* phosphoramidite
1g $110
10g $880

 

 

含有SAMRS的寡核苷酸：

 

将SAMRS碱基放入PCR和其他扩增技术所用引物中的一般规则。大写字母表示标准基数，小写字母表示SAMRS基数。 

 

  • 建议长度为20-35 nts。SAMRS碱基应在寡核苷酸3'末端的前4至5个位置使用，而不是在前面的3'碱基中使用。
  • 每个寡核苷酸应使用两个至四个SAMRS碱基，优选两个或三个SAMRS修饰。
  • SAMRS t碱基在引物二聚体的形成方面没有显示出太多的减少，因此在选择时好用a，g或c代替t。
  • 避免在由三个和四个连续相同的碱基组成的字符串中使用SAMRS碱基。例如：应避免使用ggg，ccc，aaa，ttt，gggg，cccc，aaa和tttt。
  • SAMRS碱基与标准碱基分开，例如：gGg，cCc，aaAA和tTt。
  • 如果寡核苷酸的3'末端为标准A或T，则第二个碱基也应为标准碱基，然后进行两个或三个SAMRS修饰。

 

Firebird还准备SAMRS寡核苷酸文库。

SAMRS可以在寡核苷酸中与AEGIS结合使用，以实现高度复用和高度清洁的PCR和等温扩增。请咨询。

 

与所有引物设计一样，Firebird无法保证遵循这些规则制成的寡核苷酸的性能。

 

Benner等人，2015；Glushakova et al。，2015a，2015b; Hoshika et al。，2010; Sharma等，2014；Yang等人，2015年和未发布的数据

 

 

T* phosphoramidite
1g $1050
10g $8220
A* phosphoramidite
1g $655
10g $5340
C* phosphoramidite
1g $394
10g $3150
G* phosphoramidite
1g $110
10g $880

firebirdbio 人工扩展的遗传信息系统AEGIS

发表于由

 

Firebird向研究，合成生物学和临床诊断界提供试剂创新。

Firebird提供试剂和技术，以帮助开发新的生物医学创新。开发本文介绍的几种产品是为了更好地理解DNA和RNA 的特征，使它们成为地球上生命遗传信息的载体。

该图显示了一个双螺旋的晶体结构，该双螺旋由
八种八王子组成的扩展遗传字母构建而成，G（绿色），
A（红色），C（深蓝色），T（黄色），B （水）P（蓝色） ），S（紫色）和Z （橙色）。

本目录中的试剂仅出售用于研究目的。

人工扩展的遗传信息系统（AEGIS 

Firebird通过创建AEGIS扩展了遗传字母，以解决在复杂生物介质中检测DNA时的干扰问题。

 

通过改组标准碱基的氢键供体和受体，Firebird创造了杂环，可实现Z：P和S：B碱基对的其他氢键结合方式，如下所示。这些碱基对与CG和AT“正交”。

 firebirdbio 人工扩展的遗传信息系统AEGIS 

人工扩展的遗传信息系统-dZ：dP系统：亚磷酰胺

 

 

 

 

                   

 

 

 

氢键模式：Z 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：硝基吡啶
线性分子式C 50 H 57 N 6 O 12 P 
摩尔重量964.99

 

货号：dZ-PA-101

 

100毫克 $ 720.00
1克 $ 5760.00

 

氢键模式：P 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：咪唑三嗪
线性分子式C 49 H 65 N 8 O 7 P 
摩尔重量909.08

 

货号：dP-PA-102

 

100毫克 $ 850.00
1克 $ 6800.00

 

Artificially Expanded Genetic Information Systems –dZ:dP system:  Triphosphates

人工扩展的遗传信息系统

氢键模式：Z 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：咪唑三嗪
线性分子式C 10 H 16 N 3 O 15 P 3
摩尔重量511.17

 

货号：dZTP-101

 

1微摩尔 $ 400.00
5微摩尔 $ 1600.00

 

氢键模式：P 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：咪唑三嗪
线性分子式C 10 H 16 N 5 O 13 P 3
摩尔重量493.15

 

货号：dPTP-201

 

1微摩尔 $ 420.00
5微摩尔 $ 1680.00
 

 

 

人工扩展的遗传信息系统

 

氢键模式：S 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：伪C 
线性公式C 47 H 54 N 5 O 8 P 
摩尔重量847.93

 

货号：dS-PA-104S

 

100毫克 $ 720.00
1克 $ 5760.00

 

氢键模式：B 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：嘌呤
线性式C 49 H 68 N 7 O 7 P 
摩尔重量898.08

 

货号：dB-PA-103P

 

100毫克 $ 600.00
1克 $ 4800.00

 

 

人工扩展的遗传信息系统

氢键模式：S 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：伪-C 
线性公式C 10 H 18 N 3 O 13 P 3
摩尔重量481.18

 

货号：dSTP-401S

 

1 微摩尔 $ 400.00
5 微摩尔 $ 1600.00

 

氢键模式：B 
糖：2'-脱氧核糖
杂环：嘌呤
线性式C 10 H 16 N 5 O 13 P 3
摩尔重量507.18

 

货号：dBTP-301P

 

1 微摩尔 $ 400.00
5 微摩尔 $ 1600.00

 

 

 

使用AEGIS：超净嵌套PCR

 

即使在以连续碱基对形式存在时，Z：P对仍会保留在PCR扩增过程中。

 

 

AEGIS嵌套引物可抑制多重PCR中的噪音，并支持23重PCR检测RNA病毒。

 
            

 

含有AEGIS碱基的寡核苷酸是可获得的。请咨询。

Firebird还准备了AEGIS  寡核苷酸文库  。

SAMRS可以在寡核苷酸中与AEGIS结合使用，以实现高度复用和高度清洁的PCR和等温扩增。

 

Yang等，2011；Yang等，2010；Glushakova等人，2015a

 

 

使用AEGIS：一步就可以组装长的DNA构建体

将AEGIS核苷酸添加至单链寡核苷酸可增加其信息密度。这可以使发夹，漂移链和非规范相互作用不受阻碍的单链DNA干净快速杂交。然后，使用Firebird的“音译”技术，将AEGIS核苷酸干净地替换为标准核苷酸，从而得到一个*天然的基因。

该装配的一个例子如下所示：引物尾部的S和B残基指导引物末端*序列的特异性比对。在PCR扩增过程中，SB碱基对转化为TA碱基对。

 

 

 

布拉德利和本纳，2014年；Merritt等人，2014年

 

 

使用AEGIS：增加适体多样性

dP和dZ碱基增加了核酸的化学组成，用于选择适体。特别值得注意的是dZ上存在的NO 2基团。

下图显示了AEGIS在选择对癌细胞上的细胞表面蛋白具有特异性的适体时的一种应用。

 

                       

firebirdbio产品目录

发表于由

 

firebirdbio产品目录

Reversible terminators:

可逆终止子：

即用型，无标签

带有自由 3’-ONH2 的可逆终止子可以使用，不需要

使用前脱保护或进一步处理。

6

Thymine

TONH2-171

5 µmoles $600.00

50 µmoles $ 4200.00

Cytosine

CONH2-172

5 µmoles $750.00

50 µmoles $5250.00

Adenine

AONH2-173

5 µmoles $750.00

50 µmoles $5250.00

Guanine

GONH2-174

5 µmoles $750.00

50 µmoles $5250.00

可逆终止子：
肟封闭的、无标签的可逆终止子也可与 3'-ONH2 保护为乙肟，比我们的即用型可逆终止子更适合长期储存。对于酶掺入，肟在使用前必须脱保护为游离的 3'-ONH2，这可以用缓冲的甲氧基胺水溶液原位实现。

 

Thymine TONH2-101 5 µmoles $900.00

Cytosine CONH2-102 5 µmoles $1050.00

Adenine AONH2-103 5 µmoles $1050.00

Guanine GONH2-104 5 µmoles $1050.00

 

可逆终止子：
二醇连接标签
Firebird 提供了具有 3'-ONH2（保护为乙酰肟）和携带游离氨基的二醇连接体的可逆终止子，其上可以连接一个标签（荧光染料或其他部分）。二醇可用稀高碘酸水溶液快速裂解。

 

Thymine TONH2-DT 1 µmole $1750.00

Cytosine CONH2-DT 1 µmole $1900.00

Adenine AONH2-DT 1 µmole $2200.00

Guanine GONH2-DT 1 µmole $2300.00

 

对于酶掺入，肟在使用前必须脱保护为游离的 3'-ONH2，这可以用缓冲的甲氧基胺水溶液原位实现。

可逆终止子：
二硫键连接标签
Firebird 提供了具有 3'-ONH2（保护为乙肟）和携带游离氨基的二硫键连接体的可逆终止子，其上可以连接一个标签（荧光染料或其他部分）。二硫键可以用膦或巯基试剂快速裂解。

Thymine TONH2-ST 1 µmole $ 1750.00

Cytosine CONH2-ST 1 µmole $ 2000.00

Adenine AONH2-ST 1 µmole $ 2400.00

Guanine GONH2-ST 1 µmole $ 2500.00