产品信息
产品名称 |
货号 |
规格 |
保存 |
价格(元) |
GelRed 核酸染料(500μL in water, 10,000 X) |
C1101L1122 |
500μL |
室温 |
550 |
GelRed是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有*设计的荧光染料。在游离状态下,GelRed发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光大大增强。因此,GelRed的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出PCR体系存在的双链DNA数量。GelRed与 EB 有相同的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置。标准的 EB 滤光片或 SYBR 滤光片都适用,使用与观察 EB 相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可,在 300 nm 紫外光附近可得到*激发。GelRed的zui大吸收波长约为518 nm,发射波长zui大约为605 nm。GelRed 与双链DNA的亲和力非常高,因此可以用做电泳前染色,对分子生物学中常用的酶(如:Taq 酶、逆转录酶、内切酶、T4连接酶等)没有抑制作用。另外,GelRed 与EB相比,诱变能力大大降低。
GelRedzui初由美国Biotium公司研发,艾姆斯试验表明,这种新型染料细胞透过性、诱变性方面表现优异,得到市场广泛认可。
运输与保存方法
常温运输、保存,保质期24个月。
使用方法
1.胶染法(用法同EB)
(1)制胶时加入GelRed核酸染料(例如:每50mL琼脂糖溶液中加入5μL GelRed 10,000×储液,以此比例类推)。
(2)按照常规方法进行电泳。
注意事项:
此方法染色染料用量相对较少,500 μL染料大约可以做100块50 mL的胶。
由于GelRed具有良好的热稳定性,可以在热的琼脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷却。摇晃,振荡或者翻转以保证染料充分混匀。也可以选择将GelRed储液加到琼脂糖粉末和电泳缓冲液中,然后用微波炉或其他常用方式加热以制备琼脂糖凝胶。GelRed兼容所有常用的电泳缓冲溶液。
含有染料的预制凝胶溶液可以大量制备,并长期保存直到使用。
此方法不适合预制聚丙烯酰胺凝胶,对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法。
2.泡染法
(1)按照常规方法进行电泳。
(2)用H2O将GelRed 10,000×储液稀释约3,300倍到0.1 M NaCl中,制成3×染色液。(例如将15μL GelRed 10,000×储液和5 mL 1 M NaCl加到45 mL H2O中)。
(3)将凝胶小心地放入合适的容器中,如聚丙烯容器中,缓慢加入足量的3×染色液浸没凝胶,室温振荡染色30 min左右,*染色时间根据凝胶厚度以及琼脂糖浓度不同而略有不同。对于含3.5~10%丙烯酰胺的凝胶,染色时间通常介于30 min到1 h,并随丙烯酰胺含量增加而延长。
注意事项:
1)用泡染法染色时,染料用量较多,单次使用的染色液可重复使用3次左右。3×GelRed染色液可以大量制备,在室温下避光保存直至用完。
2)如果总是看到条带弥散或分离不理想,建议使用泡染法染色以确认问题是否与染料有关。
3)如果染色后问题依旧存在,则说明问题与染料无关,请尝试:降低琼脂糖浓度、延长凝胶时间以保证边缘清晰、改进上样技巧或选择泡染法染色。
3.预染法(zui省染料的染色方法,按25μL体积上样,500μL原液理论做20万个样品)
1)该方法适用于琼脂糖凝胶电泳和PAGE凝胶电泳
2)工作液的配制:用电泳缓冲液将10000×的GelRed原液稀释1000倍,即为10 X GelRed工作液。GelRed工作液可以置2-8℃冷藏一个月以上。
3)制胶:按常规方法制胶,不含任何染料。
4)样品染色:向分析样品中加入GelRed工作液和载样缓冲液,室温放置10分钟,使GelRed与样品中DNA充分结合。GelRed工作液加入量为总上样量的1/10,使GelRed在上样时的终浓度为1X.
5)DNA Marker染色:将5μL DNA Marker和1μLGelRed工作液混匀,室温放置5分钟,使GelRed与DNA充分结合。
6)上样、电泳:按常规操作。
注意事项:
根据染料分子量小,带电荷少的特性开发本染色方法,按照一块胶10个样品计算,500μL原液理论上可以完成2万块胶的染色。
疑难解答
1. 在常规用酒精沉淀核酸的过程中,GelRed 可以全部从双链核酸上去掉。
2. 如果想对用 GelRed 染过的胶进行 Southern blots,建议在预杂化和杂化溶液中加入 0.1%- 0.3% 的SDS。
3. 在紫外照射透视下,与双链 DNA 接合的 GelRed 呈现红色荧光。
4. GelRed对玻璃和非聚丙烯材料具有一定亲合力。建议在稀释、贮存、染色等使用过程中用聚丙烯类容器。
5. GelRed原液在室温保存,如放置冰箱保存会产生部分沉淀,使用前适当加热并摇匀即可正常使用。
几种核酸染料比较
名称 |
灵敏度 |
稳定性 |
适用性 |
安全性 |
价格 |
GelRed |
高 |
高 |
通用大小片段电泳染色 |
美国安全认定无毒 |
中 |
GelGreen |
高 |
高 |
通用大小片段电泳染色 |
美国安全认定无毒 |
中 |
SYBR Green I |
* |
差 |
100bp以上片段电泳染色 |
花菁染料,低毒 |
高 |
SYBR Green II |
* |
差 |
单链核酸分子电泳染色 |
花菁染料,低毒 |
高 |
Gold View I |
低 |
高 |
500bp以上片段电泳染色 |
高毒性,强致癌 |
低 |
EB |
低 |
高 |
100bp以上片段电泳染色 |
强致癌,强诱变 |
低 |